男科学家是实际处理临床男性特有问题的医生，包括男性先天性生殖道畸形、青春期发育异常、男性不育、性功能障碍和男性衰老。几十年来，男性不育被认为无法治愈，因为大多数病人属于不明原因的精液异常。
男性附属性腺感染
男性附属性腺感染(MAGI)是前列腺、精囊腺和（或）附睾等感染／炎症的统称。MAGI可能来自性传播病原体的感染（如沙眼衣原体），或更常见于普通的尿道病原微生物，如：大肠埃希菌、变形杆菌、肠球菌或假单胞杆菌。根据疾病严重程度、持续时间和感染的部位不同对精子质量和生育力的影响存在很大差异。
MAGI通过多种机制对精子受精能力产生影响，在众多机制中最重要的是精液体积减少和（或）黏稠性增加及精浆生化成分异常，精子活力差，以及精子浓度减少。高水平的活性氧和附睾内抗氧化剂生成的减少可损伤精子膜，使精子顶体活性降低，精-卵膜融合能力降低并可导致精子DNA损伤（诱发突变）。
免疫性不育
如果血-睾屏障被破坏，免疫系统就会产生针对精子的抗体。患者因手术（如输精管结扎术）、外伤或附属性腺感染，尤其是附睾炎使输精管道部分或全部梗阻则会产生抗精子抗体而导致免疫性不育。一旦血睾屏障受到破坏，首先产生IgM(免疫球蛋白M)抗体，但是IgM抗体一般不会出现在精液中，随后在血液和精浆中会出现IgG(免疫球蛋白G)抗体，IgG抗体可以与精子紧密结合。通常情况下附睾炎患者可以产生分泌型IgA(免疫球蛋白A)抗体。
抗精子抗体通过多种机制降低精子的受精能力，包括抑制精子穿透宫颈黏液、损伤精子与卵子融合能力等。免疫反应和可以产生活性氧和精子凝集现象，同时在补体存在时可以对精子产生细胞毒性。
性功能或射精功能障碍及其他先天性或获得性因素
勃起功能障碍因为不能够将精液排送到阴道内是造成不育症较少见的因素之一，一般通过病史采集或性交后试验阴性可以发现，精液常规分析不能反映该病因。病史采集一般不能反映不射精或逆行射精情况。
不射精有时仅限于阴道内不射精，通常是身心因素造成，源于潜意识对射精反射的抑制或消除。如果精液质量满足需求，夫妇自己在“床旁”进行阴道内人工授精可以很快达到受孕的目的。
逆行射精可以是完全性的，有时是不全性逆行射精。如果患者声称具有正常的性高潮和射精冲动，但是精液量非常少，或不能够射出精液，就需要高度怀疑为逆行射精。性交后尿液内常含有较多的精子。此类患者可以在碱化尿液后收集精子行人工授精或试管婴儿治疗。
男性不育症的IUI（人工授精)治疗
IUI是部分男性因素不孕症夫妇有效的治疗方法。免疫性不育患者以及针对病因治疗或特发性精子缺乏治疗后不能恢复自然生育力的患者推荐给予IUI治疗。
IUI的成功率取决于一些关键性因素，就女方而言，推荐正确给予促性激素注射后单卵-排卵周期而非超排卵是行IUI治疗。超排卵周期IUI治疗会导致较高的受孕率，但是出生率并不能提高，而且会有双胎或多胎妊娠的风险，双胎或多胎妊娠往往在围产期具有不良妊娠结局。
IUI治疗的时机非常关键，应该在hCG注射后的37-42小时内实施。
大多数“男性因素”所致不孕不育夫妇，在治疗男性后可以解决生育问题。已经明确证明导致精子缺乏的疾病应在实施试管婴儿技术之前进行有效治疗。病因治疗联合含特定成分的营养素能显著增加受孕的成功率，降低每次孕育子女的费用，减少母亲和子代的风险。
抗精子抗体通过多种机制降低精子的受精能力，包括抑制精子穿透宫颈黏液、损伤精子与卵子融合能力等。免疫反应和可以产生活性氧和精子凝集现象，同时在补体存在时可以对精子产生细胞毒性。
