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在女性不孕症的原因中，最常见的原因就是双侧输卵管阻塞。输卵管是一对专门捡拾、输送卵细胞和受精卵的器官。通过深入研究，发现成熟卵细胞和精子在输卵管内相遇并受精。可见输卵管的存在，几乎就是为了生育。但这个就一个功能的器官，依然无法逃过被感染的困扰。急性盆腔炎最常见的后果就是输卵管伞端堵塞，或者输卵管腔变细窄，无法承担捡拾、输送精子和受精卵的任务。

在目前已知的女性不孕原因之中，输卵管伞端粘连堵塞是最常见的原因。输卵管伞端粘连轻微，可以使用腹腔镜对之进行手术，使之通畅。如果输卵管堵塞时间久，尤其形成输卵管积水后，输卵管腔内的纤毛消失，输卵管会变得僵硬且无法蠕动。在这种情况下，即使将粘连、堵塞的输卵管疏通了，也无法发挥正常作用，甚至有引起异位妊娠的可能（完全堵塞变成部分堵塞）。因此在临床上常对输卵管粘连分类，仅仅对粘连轻微的输卵管进行手术。术后一年如未怀孕，建议及时接受试管婴儿技术。对于积水严重的输卵管，最好在手术时予以切除，免得在做试管婴儿时，输卵管中的积水会再很大程度上影响成功率。研究发现，输卵管中的积水对胚胎是有毒性的，因而会降低成功率。但临床上几乎所有女性都无法接受要切除输卵管。事实上，没有功能的输卵管除了对自己有点心理安慰外，对身体完全是有害无益的。

引起不孕的第二大常见原因是子宫内膜异位症。在正常情况下，子宫内膜仅局限在子宫腔的内面生长，异常情况下，这些内膜可以在盆腔，尤其是双侧卵巢、子宫骶骨韧带、盆腔腹膜表面等部位生长，并形成一系列病灶。在不孕女性体内，近70%的盆腔内或多或少有些内异症的病灶，但内异症女性中，无法怀孕的到底占了多大比例，业界尚未达成共识。有些人认为异位症女性不孕与粘连有关，其实异位症女性的输卵管基本上都是通畅的。其不孕的原因应该与粘连无关。尽管子宫内膜异位症究竟是如何导致不孕症的原因至今不明，但学术界公认具有子宫内膜异位症的不孕症患者，应首先使用腹腔镜检查术明确诊断并采取手术对病灶尽量进行清除，并辅以相应的药物，争取尽早妊娠。一旦妊娠，那么病灶在4年内基本可以不复发。若药物治疗无效或者病灶严重，那么应该在术后尽早通过试管婴儿的方式妊娠。

不孕的第三位原因是内分泌异常，如低雌激素血症、多囊卵巢综合症、闭经泌乳综合征、促性腺激素缺陷等。最终的结果是卵巢内的卵细胞无法成熟或无法排除，造成不孕。除了女性性器官外，其他的内分泌器官异常，如肾上腺、甲状腺、胰岛素分泌异常，同样会让导致女性不孕。内分泌异常的女性需要经过相应的内科治疗而受孕，部分需要手术，还有一部分女性需要在试管婴儿的帮助下获得妊娠。

生殖器官的畸形如子宫纵膈、斜膈或生殖道的肿瘤如子宫肌瘤等在一些情况下也会导致不孕，但都可以通过手术矫正，在子宫恢复正常后也是可以长长受孕的。卵巢上的囊肿和良性肿瘤（如畸胎瘤）和卵巢旁的囊肿（如输卵管系膜囊肿）也会影响输卵管卵巢的功能，在手术切除或矫正后基本上会很快怀孕。

一般情况下结扎的输卵管吻合后，多数女性能再次生育，但如若输卵管在结扎后产生了积水，那么输卵管功能要恢复起来就可能有点困难了，原因在于积水的那段输卵管内的纤毛受到破坏，缺乏蠕动功能。这类原因常出现在高龄女性身上，一旦决定要二胎，那么在试孕期后应及时接受试管婴儿技术。